Entre as árvores, há o jequitibá-rosa a quaresmeira, o fedegoso, o ipê, a embaúda, a palmeira-juçara (que fornece o palmito), a canela, o jacarandá, o cedro e a peroba. No interior da floresta há grande variedade de trepadeiras, mata-paus e pteridófitas.
Na mata Atlântica vivem diversos mamíferos, muitos ameaçados de extinção: marsupiais (como o gambé e a cuíca-d-água), primatas (como o muriqui, o mico-leão, o mico-leão-fourado, o sagüi-preto e o macaco-prego), guaxinins (mão-pelada), coatis, onças-pintadas, gatos-do-mato, cachorros-vinagre, suçuaranas, caxinguelês, cutias, ouriços-cachoerios, porcos-do-mato, tatus, pacas, tamanduás-mirins, capivaras, antas e preguiças.
Entre as aves: macuco, inhambu, patos selvagens, gaviões, mutum, saracura, tié-sangue, sanhaço, araponga e muitas espécies de beija-flor.
Os répteis são respresentados pelos teipus (lagartos que podem ter mais de 1 metro de comprimentos), calangos, lagartixas, cágados, jabutis, jararacas, cobras-corais, surucucu e jibóia. Além deles, existem anfíbios, peixes e invertebrados.
Desde o início da colonização, a mata Atlântica foi o ecossistema que mais sofreu com a ação humana. A extração do pau-brasil (usado como fonte de corante vermelho para tecidos), o ciclo da cana-de-açúcar e o do café, a mineração, a extração de madeiras nobres, a pecuária, a caça predatória e a ocupação de cidades (cerca de 2/3 da população vivem em áreas originalmente ocupadas pela mata Atlântica) foramm os principais fatores da devastação ecológica dessa região. Restam apenas cerca de 7%, pouco mais de 10.000 km2, transformados em parques estaduais e nacionais, protegidos por lei.
Com o cerrado, a mata Atlântica é o ecossistema mais ameaçado do mundo, ao mesmo tempo que é um dos 25 hotspots(pontos quentes, em inglês), ou seja, regiões de grande biodiversidade e amaeaçadas de extinção. Ela apresenta também muitas espécies endêmicas (espécies exclusivas desse bioma).
46 - Biodiversidade - Distribuição da vida na biosfera
46-a-Tundra
46-b-Taiga
46-c-Florestas Temperadas
46-d-Florestas Tropicais
46-e-Campos
46-f-Desertos
47- Ameaças à biodiversidade
48- Biociclo Marinho
49- Biomas Brasileiros
49-a- Floresta Amazônica
49-b- Mata Atlântica
49-c- Caatinga
49-d- Cerrado
49-e- Pampas
49-f- Pantanal
49-g- Mata de Araucária
49-h- Mata dos Cocais
49-i- Manguezal
50- Distribuição Geográfica dos Animais
49-a- Floresta Amazônica
49-b- Mata Atlântica
49-c- Caatinga
49-d- Cerrado
49-e- Pampas
49-f- Pantanal
49-g- Mata de Araucária
49-h- Mata dos Cocais
49-i- Manguezal
50- Distribuição Geográfica dos Animais